Перевірка відповідності системи управління якістю компанії вимогам стандарту складається із оцінки внутрішніх процесів, документації, виробничих практик, а також аналізу управління ризиками та контролю якості на всіх етапах.
Внутрішній аудит
Проводить компанія раз на рік або, за потреби, кілька разів на рік для перевірки власної СУЯ. Це регулярний процес, який допомагає виявляти невідповідності під час проектування, розробки, закупівлі сировини та матеріалів, виробництва, контролю, зберігання, постачання, сервісу, зворотного звязку з замовником, після продажного клінічного нагляду. Внутрішній аудит дозволяє компанії самостійно коригувати можливі проблеми, покращувати ефективність процесів та забезпечувати відповідність вимогам стандарту.
Зовнішній (сертифікаційний) аудит
Аудит, який проводить незалежний сертифікаційний орган для перевірки відповідності компанії вимогам ISO 13485. Успішне проходження зовнішнього аудиту є обов'язковою умовою для отримання Сертифікату ISO 13485.